EWAS在用于临床样本检测时一般采用人DNA甲基化芯片

芯片名称：Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChip (850K芯片)

芯片特点

1）  全面的基因组覆盖范围：检测> 850,000个CpG位点，全面覆盖CpG岛、启动子、编码区及增强子。

2） 高质量的数据：沿用了450k芯片的Infinium技术，同时采用Infinium I及II探针设计，扩大检测范围。

3）  分辨率高：单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的准确位点。

4）可重复性高：自身技术重复间的相关性以及与450K相同探针间的相关性R2 >0.98。

5） 起始模板量低：仅需250ng，大大节约了样品量。

6）   适用于FFPE样本