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科技服务 CLIP-Seq
表观遗传水平-CLIP-Seq

紫外交联免疫沉淀 (crosslinking-immunprecipitation, clip) 结合高通量测序,即CLIP-Seq又称为HITS-CLIP。是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。


其主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加接头、RT-PCR等步骤,对这些分子进行高通量测序,再经生物信息学的分析和处理、总结,挖掘出其特定规律,从而深入揭示RNA结合蛋白与RNA分子的调控作用及其对生命的意义。

 

技术优势
 
1) 全转录组范围内研究RNA结合蛋白和RNA相互作用网络
2 活细胞原位研究RNA结合蛋白和RNA相互作用
3 通过紫外交联可以加强RNA结合强度,从而可以鉴定到实际结合的短序列
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