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基因组水平－宏基因组
Metagenomicdiscovery of biomass-degrading genes and genomes from cow rumen.
Science. 2011 Jan 28; 331(6016): 463-7.
通过研究牛的消化机制，来寻找可用于生产第二代生物燃料的酶。 研究者将柳枝稷样品置于牛的瘤胃中培养72小时，然后对附着在柳枝稷样品上的所有微生物进行宏基因组测序（268G）。获得了大量碳水化合物活性基因，对其中部分基因表达后得到产物进行研究，发现57%蛋白酶产物对植物中的纤维素显示出活性， 属于可分解纤维素的酶。此外通过测序结果组装了15种无法培养的微生物基因组，并通过其他方法得到证实。
研究方法
结果分析
候选基因与碳水化合物活性酶（CAZy）的数据库进行序列比对，发现存在较高的相似性
宏基因组测序获得15种无法培养的微生物序列
参考文献
[1] Hess M, Sczyrba A, Egan R, et al.Metagenomic discovery of biomass-degrading genes and genomes from cow rumen. Science, 2011, 331:63-67.
[2] Castellarin M, Warren RL, Freeman JD, et al.Fusobacterium nucleatum infection is prevalent in human colorectal carcinoma. Genome Research, 2012, 2:299-306.
