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科技服务 mRNA 甲基化测序
表观遗传学研究服务-mRNA 甲基化测序

Meyer K D, Saletore Y, Zumbo P, et al. Comprehensive analysis of mRNA methylation reveals enrichment in 3′ UTRs and near stop codons[J]. Cell, 2012, 149(7): 1635-1646.
Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, et al. Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq[J]. Nature, 2012, 485(7397): 201-206.

 

研究背景


1.早在四十年前,人们就发现信使RNA上存在着腺嘌呤上的甲基化修饰(m6A)。这种m6A修饰非常普遍,出现频率大约是3-5个残基/mRNA。不过当时人们并不清楚这种修饰有何功能。
2. 2012年两项RNA“甲基化组”研究,两个不同的课题组同时利用MeRIP-Seq技术鉴定了整个转录组中发生了m6A修饰的mRNA。

 

研究方法


1. 利用核糖体除去法提取小鼠,人类细胞系的mRNA。
2. MeRIP-seq。
3. 数据分析。

 
结果分析

 

1. 全基因组范围内比对了人类和小鼠mRNA甲基化分布,发现mRNA甲基化在人和小鼠有着高度的保守型。同时分析了mRNA甲基化在基因上的分布特征,发现mRNA主要分布在mRNA的终止密码子附近。

 

2. mRNA与mRNA的表达量具有相关性,并且调控了mRNA的剪切拼接过程。

 

3. mRNA甲基化的功能:与microRNA具有相关性,并且mRNA甲基化的水平受到环境因素的影响,主要参与了RNA的代谢过程。

 

参考文献

 

[1] Meyer K D, Saletore Y, Zumbo P, et al. Comprehensive analysis of mRNA methylation reveals enrichment in 3′ UTRs and near stop codons[J]. Cell, 2012, 149(7): 1635-1646.
[2] Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, et al. Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq[J]. Nature, 2012, 485(7397): 201-206.
[3] Wang X, Lu Z, Gomez A, et al. N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability[J]. Nature, 2013.
[4]  Fustin J M, Doi M, Yamaguchi Y, et al. RNA-methylation-dependent RNA processing controls the speed of the circadian clock[J]. Cell, 2013, 155(4): 793-806.

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